Methods in biotechnology / Seung-Beom Hong, M. Bazlur Rashid, Lory Z. Santiago-Vázquez.

1: Lab measurements, 3 2 MB experiment 2: Use of the spectrophotometer and Beer's law, 9 3 MB experiment 3: Making solutions and buffer efficacy, 15 4 MB experiment 4: Acid base titration, 19 5 MB experiment 5: Protein denaturation and precipitation, 23 6 MB experiment 6: Bacterial transformation, 27 7 MB experiment 7: GFP purification, 33 8 MB experiment 8: SDS-PAGE analysis, 37 9 MB experiment 9: DNA isolation, 41 10 MB experiment 10: PCR-based Alu-human DNA typing, 45 11 MB experiment 11: Restriction enzyme digestion, 51 12 MB experiment 12: Agarose gel electrophoresis, 53 13 MB experiment 13: Ouchterlony and ELISA immunoassays, 57 14 MB experiment 14: Testing plant substances for antimicrobial activity, 63 15 MB experiment 15: Peroxidase enzyme activity assay, 67 Part II: ADVANCED METHODS IN BIOTECHNOLOGY (AMB) 1 LABORATORY EXERCISES 71 16 AMB 1 experiment 16: Aseptic technique and culture handling, 73 17 AMB 1 experiment 17: Yeast culture media preparation, 77 18 AMB 1 experiment 18: Growth curve, 79 19 AMB 1 experiment 19: Mini plasmid prep, 83 20 AMB 1 experiment 20: Restriction digestion, purification, concentration, and quantification of DNA, 87 21 AMB 1 experiment 21: Polymerase chain reaction (PCR), 91 22 AMB 1 experiment 22: TA, blunt end, SLIC, and CPEC cloning of PCR product, 97 23 AMB 1 experiment 23: One-step multifragment assembly cloning, 103 24 AMB 1 experiment 24: Restriction enzyme digestion and fast agarose gel electrophoresis, 111 25 AMB 1 experiment 25: Southern blot transfer, 117 26 AMB 1 experiment 26: Probe labeling and purification, 121 27 AMB 1 experiment 27: Dot blot assay, 125 28 AMB 1 experiment 28: Pre-hybridization, hybridization, and detection, 127 29 AMB 1 experiment 29: Total yeast RNA isolation and RT-PCR, 131 30 AMB 1 experiment 30: Yeast-based in vivo recombination cloning, 139 31 AMB 1 experiment 31: Plasmid DNA isolation from yeast, 143 32 AMB 1 experiment 32: E. coli transformation with yeast plasmid DNA, 145 33 AMB 1 experiment 33: X-gal filter lift assay, 147 34 AMB 1 experiment 34: Protein quantitation assay, 149 35 AMB 1 experiment 35: Quantitative -Galactosidase assay in yeast, 155 36 AMB 1 experiment 36: Gel filtration chromatography (GFC), 161 37 AMB 1 experiment 37: Ion exchange chromatography (IEC), 165 Part III: ADVANCED METHODS IN BIOTECHNOLOGY (AMB) 2 LABORATORY EXERCISES 169 38 AMB 2 experiment 38: E. coli culture media preparation, 171 39 AMB 2 experiment 39: Site-directed mutagenesis, 175 40 AMB 2 experiment 40: Protein expression in E. coli, 179 41 AMB 2 experiment 41: Protein purification by affinity column chromatography, 187 42 AMB 2 experiment 42: SDS-PAGE analysis of affinity column fractions, 193 43 AMB 2 experiment 43: Western blot analysis of affinity column fractions, 199 44 AMB 2 experiment 44: Yeast media preparation and phenotypic analysis of yeast strains, 203 45 AMB 2 experiment 45: Yeast transformation for yeast two-hybrid (Y2H) assay and genome editing by CRISPR-Cas system, 209 46 AMB 2 experiment 46: Yeast mating-mediated Y2H assay and genomic PCR, 215 47 AMB 2 experiment 47: Yeast colony PCR screening and cycle DNA sequencing, 221 48 AMB 2 experiment 48: DNA sequencing electrophoresis, 227 49 AMB 2 experiment 49: RNA interference, 237 50 AMB 2 experiment 50: Protein preparation for 2D gel electrophoresis, 241 51 AMB 2 experiment 51: Two-dimensional gel electrophoresis, 245 Part IV: APPENDICES 253 1 Methods in Biotechnology